Μετά την 16η εβδομάδα μπορεί να πραγματοποιηθεί η αμνιοπαρακέντηση όπου αυτό απαιτείται, όταν δηλαδή:
- Το αποτέλεσμα της αυχενικής διαφάνειας έδειξε αυξημένα ποσοστά για σύνδρομο Down ή τρισωμία 13, 18 ή 21
- Κατά τον υπερηχογραφικό έλεγχο φαίνεται ότι το έμβρυο παρουσιάζει μια ανωμαλία που σχετίζεται με χρωμοσωμική ανωμαλία
- Υπάρχει ατομικό ή οικογενειακό ιστορικό που αυξάνει την πιθανότητα εμφάνισης συνδρόμου Down ή άλλων χρωμοσωμικών ανωμαλιών